狄仁杰初任大理寺丞，在给老师阎立本过寿时，结识了王恒，王恒是个孤儿从小被道士收养，据说其擅长炫术，是皇帝身边的红人。正逢江南大旱农民暴动，追随修罗教，教主人称“不死修罗”。阎立本告诉狄如果能去查清楚案情，便可在朝廷有一席之地，却被王恒告知此会有危险。
狄赴江南后先后遭遇被人下毒、追杀，幸鹿鸣急时赶到，化险为夷。狄仁杰在调查档案发现档案被掉包，知情的老宫女也被人杀死。狄仁杰在与一伙蒙面人打斗过程中发现这些人用的兵器有隋朝兵器的特点，狄被困地道，后被熟悉地形的花匠女儿子衿救出，后地宫内隋炀帝幺女杨氏现身，此时巡抚带官兵赶到，众人以为不死修罗是杨氏便杀了杨氏。
狄为子衿疗伤，两人暗生情愫，子衿想和狄归隐山林，狄不想去，两人痛苦纠结，
这时，不死修罗发号施令，向朝廷宣战。狄潜入地宫，发现修罗教正举行大典，狄上前和教主打斗，生擒教主后教主被人用暗箭射死。
本以为修罗教主已死，不死修罗事件告一段落，没想到不死修罗再次现身，与此前狄仁杰杀死的教主一摸一样，与狄仁杰与鹿鸣等人拼死相抗，众人确定“不死修罗”这次彻底死亡，令人匪夷所思的事件又出现了，相同长相的“不死修罗”再次出现，到底是易容术还是真的有不死之术？
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